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新藥研發(fā)麵臨設(shè)計(jì)難度大,投資大、周期長(zhǎng),失敗率高巨大挑戰

新藥研發(fā)通常投入超10億美元、周期超10年,同時(shí)成功率往往不足1/10。

藥物分子的設(shè)計(jì)和晶片的設(shè)計(jì)一樣,難度大,投資大、周期長(zhǎng),失敗率高。這些問(wèn)題長(zhǎng)期困擾製藥行業(yè),製藥業(yè)的發(fā)展速度無(wú)法滿(mǎn)足當(dāng)下人類(lèi)的各種健康需求,特別是新冠這樣的突發(fā)疫情,以及癌症、海默症等一直沒有特效藥的頑症等,都對(duì)新藥研發(fā)非常迫切。

傳統(tǒng)的製藥模式中,藥物結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)高度依賴專(zhuān)家經(jīng)驗(yàn)、新藥篩選失敗率高、藥企的投資回報(bào)率不斷下降等情況使得行業(yè)迫切需要變革。


展開(kāi)詳情

華為雲盤(pán)古藥物分子大模型,大幅提升藥物設(shè)計(jì)效率

華為雲深度聯(lián)合中國(guó)科學(xué)院上海藥物研究所,

共同訓(xùn)練了華為雲盤(pán)古藥物分子大模型,賦能全流程的AI藥物設(shè)計(jì)。

  • 針對(duì)化合物表徵學(xué)習(xí)的全新深度學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)

    華為雲盤(pán)古藥物分子大模型首次採用不對(duì)稱(chēng)條件變分自編碼器架構(gòu),自動(dòng)找出化合物關(guān)鍵的分子特徵指紋,極大提升了下遊任務(wù)的準(zhǔn)確性。

    華為雲盤(pán)古藥物分子大模型首次採用不對(duì)稱(chēng)條件變分自編碼器架構(gòu),自動(dòng)找出化合物關(guān)鍵的分子特徵指紋,極大提升了下遊任務(wù)的準(zhǔn)確性。

  • 進(jìn)行了超大規(guī)模化合物表徵模型的訓(xùn)練

    對(duì)市面上真實(shí)存在的17億個(gè)藥物分子的化學(xué)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預訓(xùn)練,在化學(xué)無(wú)監(jiān)督學(xué)習(xí)模式下,實(shí)現(xiàn)結(jié)構(gòu)重構(gòu)率、合法性、唯一性等指標(biāo)全面優(yōu)於現(xiàn)有方法。

    對(duì)市面上真實(shí)存在的17億個(gè)藥物分子的化學(xué)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預訓(xùn)練,在化學(xué)無(wú)監(jiān)督學(xué)習(xí)模式下,實(shí)現(xiàn)結(jié)構(gòu)重構(gòu)率、合法性、唯一性等指標(biāo)全面優(yōu)於現(xiàn)有方法。

  • 生成了擁有1億個(gè)新化合物的資料庫(kù)

    分子生成器生成了1億個(gè)創(chuàng)新的類(lèi)藥物小分子篩選庫(kù),其結(jié)構(gòu)新穎性為99.68%,並且可以有效地生成理化性質(zhì)相似的新化合物,為發(fā)現(xiàn)新藥創(chuàng)造可能性。此外,基於盤(pán)古分子優(yōu)化器,科研人員實(shí)現(xiàn)了對(duì)起始分子化學(xué)結(jié)構(gòu)的優(yōu)化,並且能夠改善藥物分子的特性。

    分子生成器生成了1億個(gè)創(chuàng)新的類(lèi)藥物小分子篩選庫(kù),其結(jié)構(gòu)新穎性為99.68%,並且可以有效地生成理化性質(zhì)相似的新化合物,為發(fā)現(xiàn)新藥創(chuàng)造可能性。此外,基於盤(pán)古分子優(yōu)化器,科研人員實(shí)現(xiàn)了對(duì)起始分子化學(xué)結(jié)構(gòu)的優(yōu)化,並且能夠改善藥物分子的特性。

  • 在20餘項(xiàng)藥物發(fā)現(xiàn)任務(wù)上實(shí)現(xiàn)性能最優(yōu)(SOTA)

    在多項(xiàng)任務(wù)中取得了領(lǐng)先的預測(cè)準(zhǔn)確度,包括化合物-靶標(biāo)相互作用預測(cè)、化合物ADME/T屬性評(píng)分、化合物分子生成與優(yōu)化等,實(shí)現(xiàn)了一個(gè)大模型賦能藥物發(fā)現(xiàn)全鏈條任務(wù)。

    在多項(xiàng)任務(wù)中取得了領(lǐng)先的預測(cè)準(zhǔn)確度,包括化合物-靶標(biāo)相互作用預測(cè)、化合物ADME/T屬性評(píng)分、化合物分子生成與優(yōu)化等,實(shí)現(xiàn)了一個(gè)大模型賦能藥物發(fā)現(xiàn)全鏈條任務(wù)。

解決方案

華為雲聯(lián)合中國(guó)科學(xué)院上海藥物研究所,共同訓(xùn)練了華為雲盤(pán)古藥物分子大模型。依託華為雲一站式醫(yī)療研發(fā)平臺(tái)EIHealth,盤(pán)古藥物分子大模型學(xué)習(xí)了17億個(gè)藥物分子的化學(xué)結(jié)構(gòu)。在藥物生成方面,實(shí)現(xiàn)了對(duì)小分子化合物的獨(dú)特信息的深度表徵、對(duì)靶點(diǎn)蛋白質(zhì)的計(jì)算與匹配以及對(duì)新分子生化屬性的預測(cè),從而高效生成藥物新分子;在藥物優(yōu)化方面,實(shí)現(xiàn)了對(duì)篩選後的先導(dǎo)藥進(jìn)行定向優(yōu)化。

在實(shí)際應(yīng)用中,華為雲聯(lián)合西安交通大學(xué)第一附屬醫(yī)院,基於華為雲盤(pán)古藥物分子大模型研發(fā)出全新的廣(guǎng)譜抗菌藥物,將先導(dǎo)藥的研發(fā)周期從數(shù)年縮短至一個(gè)月,華為雲盤(pán)古藥物分子大模型的落地有望革命性地提升新藥的研發(fā)效率。


中科院上海藥物研究所是華為雲的戰略合作夥伴,我們課題組聯(lián)合華為雲醫(yī)療智能體團(tuán)隊(duì)共同研發(fā)藥物領(lǐng)域最大的億級(jí)參數(shù)盤(pán)古藥 物分子大模型。針對(duì)分子結(jié)構(gòu)特點(diǎn),開(kāi)發(fā)出業(yè)界獨(dú)有的圖 - 序列非對(duì)稱(chēng)自編碼器對(duì) 17 億類(lèi)藥分子結(jié)構(gòu)進(jìn)行預訓(xùn)練。該模型在分子生成、 分子性質(zhì)預測(cè)和分子結(jié)構(gòu)優(yōu)化相關(guān)的 20 多個(gè)下遊任務(wù)中取得了業(yè)界最優(yōu)的性能,實(shí)現(xiàn)全流程的 AI 輔助藥物設(shè)計(jì),大幅縮短藥物發(fā) 現(xiàn)周期。相信華為雲盤(pán)古藥物分子大模型未來(lái)將會(huì)為守護(hù)人類(lèi)健康貢獻(xiàn)更多的力量。

鄭明月中科院上海藥物研究所 博導(dǎo)


鄭明月
中科院上海藥物研究所 博導(dǎo)

中科院上海藥物研究所是華為雲的戰略合作夥伴,我們課題組聯(lián)合華為雲醫(yī)療智能體團(tuán)隊(duì)共同研發(fā)藥物領(lǐng)域最大的億級(jí)參數(shù)盤(pán)古藥 物分子大模型。針對(duì)分子結(jié)構(gòu)特點(diǎn),開(kāi)發(fā)出業(yè)界獨(dú)有的圖 - 序列非對(duì)稱(chēng)自編碼器對(duì) 17 億類(lèi)藥分子結(jié)構(gòu)進(jìn)行預訓(xùn)練。該模型在分子生成、 分子性質(zhì)預測(cè)和分子結(jié)構(gòu)優(yōu)化相關(guān)的 20 多個(gè)下遊任務(wù)中取得了業(yè)界最優(yōu)的性能,實(shí)現(xiàn)全流程的 AI 輔助藥物設(shè)計(jì),大幅縮短藥物發(fā) 現(xiàn)周期。相信華為雲盤(pán)古藥物分子大模型未來(lái)將會(huì)為守護(hù)人類(lèi)健康貢獻(xiàn)更多的力量。

我們團(tuán)隊(duì)研究對(duì)抗細(xì)菌耐藥的新靶標(biāo)新機(jī)制,在早期研 發(fā)中驗(yàn)證了細(xì)菌組蛋白 Hu 可以作為對(duì)抗細(xì)菌耐藥的靶標(biāo)。去年我們與華為 雲醫(yī)療智能體團(tuán)隊(duì)一起發(fā)布了神農(nóng)新冠病毒藥物篩選平臺(tái),有很好的合作基礎(chǔ)。今年在華為雲盤(pán)古藥物分子大模型的幫助下,我們 快速找到針對(duì) Hu 蛋白的活性分子,並在小鼠實(shí)驗(yàn)中得到驗(yàn)證。華為雲盤(pán)古藥物分子模型使分子毒性降低的同時(shí),提高了分子的抗 菌活性,助力找到了全新的廣(guǎng)譜抗菌藥物,先導(dǎo)藥研發(fā)周期從數(shù)年縮短到一個(gè)月。非常感謝華為雲醫(yī)療智能體團(tuán)隊(duì)的支持。 祝華為雲盤(pán)古藥物分子大模型越做越強(qiáng),更好地服務(wù)於企業(yè)和科研工作者。

劉冰西安交通大學(xué) 蛋白科學(xué)與噬菌體研究所所長(zhǎng)


劉冰
西安交通大學(xué) 蛋白科學(xué)與噬菌體研究所所長(zhǎng)

我們團(tuán)隊(duì)研究對(duì)抗細(xì)菌耐藥的新靶標(biāo)新機(jī)制,在早期研 發(fā)中驗(yàn)證了細(xì)菌組蛋白 Hu 可以作為對(duì)抗細(xì)菌耐藥的靶標(biāo)。去年我們與華為 雲醫(yī)療智能體團(tuán)隊(duì)一起發(fā)布了神農(nóng)新冠病毒藥物篩選平臺(tái),有很好的合作基礎(chǔ)。今年在華為雲盤(pán)古藥物分子大模型的幫助下,我們 快速找到針對(duì) Hu 蛋白的活性分子,並在小鼠實(shí)驗(yàn)中得到驗(yàn)證。華為雲盤(pán)古藥物分子模型使分子毒性降低的同時(shí),提高了分子的抗 菌活性,助力找到了全新的廣(guǎng)譜抗菌藥物,先導(dǎo)藥研發(fā)周期從數(shù)年縮短到一個(gè)月。非常感謝華為雲醫(yī)療智能體團(tuán)隊(duì)的支持。 祝華為雲盤(pán)古藥物分子大模型越做越強(qiáng),更好地服務(wù)於企業(yè)和科研工作者。